仁波切開示道︰「佛陀教法必須經過實修方可印證，學術研究徒勞而無功，兩腳書櫥無法幫助眾生解脫煩惱、痛苦，只有增加傲慢，而落入『所知障』的深淵中，無法超越三界輪迴。」

仁波切一向秉持「理論與實修並重」的教法精神，當僧眾們完成佛學院九年義理課程後，仁波切會視學僧的資質因緣給予閉關實修的指示。而如法的閉關必須具備兩大條件：一、擁有不間斷且正確清淨傳承的成就上師與教法；二、無誤的信心與實修，方可看到究竟的結果。

為裨益佛子們進行閉關實修，於一九九九年底，完成了桑耶紀念光明林閉關中心，共有24間關房及大殿。

在三年三個月又三天的閉關實修期間，與外界隔絕，專心修持仁波切所賜予的實修教法，直到圓滿。